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比赛名称:HuBMAP + HPA - Hacking the Human Body 分割多器官功能组织单元
比赛链接:https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-organ-segmentation
比赛类型:计算机视觉、语义分割
比赛背景人类生物分子图谱计划(HuBMAP) 正在努力在细胞水平上创建人类参考图谱,旨在绘制人类细胞、组织和器官中的蛋白质表达图。
在本次比赛中,您将识别和分割五个人体器官的功能性组织单位 (FTU)。您将使用组织切片图像数据集构建模型,并尽可能准确地分割 FTU。如果成功,您将有助于加速世界对细胞和组织组织之间关系的理解。
比赛任务您将使用组织切片图像数据集构建模型,并尽可能准确地分割器官功能组织单元。
评价指标使用 Dice coefficient进行评价,通过对比真实标签与选手提交的预测结果:
数据描述训练数据集由来自公共 HPA 数据的数据组成,公共测试集是私有 HPA 数据和 HuBMAP 数据的组合,私有测试集仅包含 HuBMAP 数据。
[train/test].csv:训练/测试集的元数据
[train/test]_images/:训练/测试集的图像
train_annotations/:训练集标签
比赛赛程
2022年9月15日:报名截止日期。您必须在此日期之前接受比赛规则才能参加比赛。
2022年9月15日:团队合并截止日期。这是参与者加入或合并团队的最后一天。
2022年9月22日:最终提交截止日期。
赛题奖金
1st Place - $15,000
2nd Place - $10,000
3rd Place - $5,000
解题思路赛题是典型的语义分割赛题,需要使用语义分割的模型来完成。在完成的过程需要考虑对图像进行切分,搭建鲁邦的模型。
参考思路:https://www.kaggle.com/code/realneuralnetwork/fork-of-inference-fastai-baseline
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